Beilstein使用方法交流
原作者：xhlbudd【0628】【活动】Beilstein使用方法交流（有奖）
CrossFire Beilstein是世界上最大的关于有机化学事实的数据库，数据来源于175种期刊，已收录9百多万个化合物和9百多万个反应。作为最基本的化学文献数据库，CrossFire Beilstein能帮助有机化学研究人员形成新思路、设计合成路径（包括起始原料和中间体）、确定生物活性和物理性质、了解外界环境对化合物的影响，等等。主要数据的索引分为3部分：化学物质部分收集了结构信息及相关的事实和参考文献，包括化学、物理和生物活性数据；反应部分提供化学物质制备的详细资料，帮助研究人员用反应式检索特定的反应路径；文献部分包括引用、文献标题和文摘，化学物质部分和反应部分的条目与文献部分有超链接。
大家在使用Beilstein的过程中，一定有自己的经验、体会、技巧，希望大家能发上来与鸭绿江站友分享，最好是自己切身的体会，当然，有意义的转帖也可以。 原作者：高分子材料
Beilstein的EasyDataSearch非常有用，在这点上比SciFinder要好，但是Beilstein采用的文献多是发表的期刊文章，专利方面的文献不如SciFinder多，应该说两者结合起来的话最好 原作者：sanjiayao
先发个Beilstein图文教程,PPT(长春应化所)
[email]FUZQ024@163.COM[/email]
MM:111111
请从下面的链接下载
匿名提取文件连接 [url]http://pickup.mofile.com/9249216507033483[/url]
或登录Mofile，使用提取码 9249216507033483 提取文件 原作者：wangj799
CrossFire Beilstein使用说明 ：
1.安装
在使用 Beilstain/Gemlin化学资料数据库之前,需先下载并安装客户端程序 (说明：该安装软件为压缩文件，44.1MB，下载之后需要解压缩，并将解压缩的文件extract到一个文件夹里,运行setup.exe,便可以自动执行安装，注意不要在winzip的临时文件夹里直接运行setup.exe.)
当提示输入TCP/IP地址时，请输入： crossfire2.calis.edu.cn
当提示输入 group名字时，请输入给您指定的group名： xinjiang
全部组件安装完毕后，请重启机器。
2.重启机器后，双击桌面上的CrossFire Commander快捷键启动程序，单击Connect键开始连接，当提示输入
用户名 /密码时，输入给您指定的 用户名： xinjiang
密码： xj()09 ，
连接成功后，就可以开始使用了 原作者：qiankun0876
beilstein的客户端容易下载,上网搜索一下就可以,比如:[url]http://minerva.library.wisc.edu/commander/MDLCrossFireCommander70.exe[/url]
beilstein在安装的时候会要求你输入服务器地址.登陆的时候要求输入用户和密码.能上beilstein的学校都有自己的用户和密码,但有ip限制.
socks代理网络上公布的很多,不过免费的当然时间都比较短了.如果你离开以后还想使用scifinder一是你自己找代理,二是你现在所在地方的朋友给你开socks代理(不过估计很少有人会这么做,一旦被学校或单位知道他自己也就没法用了,呵呵). 原作者：xyj007
CrossFireBeilstein数据库是世界上最大的有机化户还可以在桌面上直接访问期刊上的文献原文。学事实数据库,数据来源为1779～1959年《BeilsteinHandbook》、《Beilstein有机化学大全》从正编到第2检索方法四补编的全部内容和1960年以来的原始文献(各种国CrossFireGmelin/Beilstein数据库有3种基本检索方式:关键词检索(TextSearch)、数据检索(FactSearch)和结构检索(StructureSearch)。关键词检索方法相对简单。数据检索也称为快速检索(EasyDataSearch),对于没有结构的物质的查找十分有效。结构检索对化学工作者来说更加方便,也更直观,只须通过一个画图软件画出化合物(或反应)的部分或精确结构(可以添加各种结构限制),就可以开始检索了。在此基础上,系统还提供了组合检索和二次检索两种高级检索方式,下面就以具体实例详细介绍数据库的各种检索方法。
1 关键词检索(TextSearch)
关键词检索是一种简便易行的文本数据检索, 适
用于检索策略较为简单的查询。用户只需在文本输入
框中输入要检索的关键词,可以输入一个也可以同时
输入多个关键词,多个关键词之间可以进行“near”、“and”、“next”、“not”、“or”以及“proximity”等6种布尔组配。实例1:查找硫酸(SulfuricAcid)的物理和化学性质,具体方法如下:
在文本框中输入SulfuricAcid或者Sulfuricandacid,当多个关键词间的关系为“和”的时候,可以用空格来代替逻辑运算符“and”。截词选框(Trun-cate)为不选,当输入的词不确定时,可以使用截词符,用“?”代替一个字符,用“*”代替任意多个字符,单击截词选框,还可以选择左截断或者右截断,系统默认为右截断。然后点击Search选框的下拉箭头,系统提供了物质(Substances)、反应(Re-actions)和引文(Citations)3种检索方式,用户根据检索要求选择适合的检索方式,本例中选择物质(Sub-stances),然后点击开始检索按钮(StartSearch),进入下一层界面:选择选项(SelectContext)界面。在此界面系统也提供了物质(Substances)、反应(Reac-tions)和引文(Citations)3种方式,用户可以根据自己的要求选择一种或同时选择几种,点击“StartSearch”按钮,系统自动进行检索,跳到检索结果界面。
2 数据检索(FactSearch)
数据检索实际上相当于一个高级检索,它有2种方式:一是在表格编辑窗口直接填写表单,二是在高级检索(AdvancedSearch)界面编辑检索式。表格检索是一种方便灵活而又直观的检索方式,它可以将不同的数据类型用多种逻辑算符进行组配。同时,在检索字段设定时,又可以随时调用各检索字段代码以及有关该字段检索词的索引字典,确保了检索字段代码及检索词输入的准确性;而高级检索界面要求用户直接输入检索式,检索式的输入必须准确,只有专业人员才能做到,所以在日常的检索中我们最常用到的是表格检索。
实例2:寻找一种溶剂,要求它在760毫米汞柱下的沸点<120℃,同时它不能含氯,而且需要知道它的浓度和黏度,具体方法如下:
在检索字段代码(FieldName)输入框中输入
“BoilingPoint(BP)”,由于CrossFireGmelin/Beilstein数据库检索字段都有其固定的代码,在填充表格时,对于不了解的数据域(Field),可以在左上角的文本框中输入关键词,在左侧的索引中查找数据域名(FieldName)。例如,在文本框中输入“boiling”,点击按钮“Find”,左侧的按钮便会自动展开,将其中的BoilingPoint数据域用高亮的背景颜色显示出来,双击BoilingPoint数据域,在字段代码(FieldName)框中自动填上“BoilingPoint(BP)”,然后用同样的方法填上Pressure(BP.P)、Densityoftheliquid(DEN)、DynamicViscosity(DV)和ElementCount(ELC)。在填充数据内容(FieldContent)时,可以直接输入与该检索字段一致的物质性质的数据,也可以通过右侧List所在列的下拉按钮获得帮助。单击“▼”按钮,系统会提供一个对话框来提示如何填写数值,按照页面提示填上相应的数值,然后点击OK按钮,系统自动将数值填充到数据内容(FieldCon-tent)表格中。在数据域名和数据内容的关系(Rela-tion)的设定框中,系统提供了“is”、“Startswith”、“endswith”、“:”、“<”、“<=”、“>”、“>=”以及“Exists”等几种关系,用户根据自己的要求设定相应的关系。在逻辑运算符(Opera-tor)设定框中,CrossFireGmelin/Beilstein提供了
“and”、“or”、“not”、“proximity”、“near”以及“next”等6种算符,用户根据课题要求设定相应的算符。注意:“proximity”不但要求两个条件同时存在,而且两者必须是相关的。然后点击“StartSearch”按钮开始检索。
3 结构检索(StructureSearch)
结构检索是CrossFireGmelin/Beilstein数据库特有的检索方式。它通过内嵌的绘制结构软件ISISDraw,绘制出物质结构或反应结构式,从而达到检索的目的。CrossFire结构编辑器功能强大,不但可以绘制物质结构或反应结构式,还可以对所绘制的结
构进行立体及属性限定。实例3:查询由β-萘己酮制备β-萘甲酸的反应,具体办法如下:
在结构编辑窗口(StructureEditor)内双击或单击绘制结构(DrawStructure)图标,激活内嵌的绘制结构软件ISISDraw,弹出分子结构编辑窗口,系统自动进入编辑模式,利用分子结构模版和系统提供的多项功能键,画出所需的反应式,点击左上角的返回Commander窗口按钮,系统自动返回到Comman-der窗口。然后,用户可以对所画的结构进行限定,如选择FreeSite中的杂原子(Heteroatom)或所有原子(allatom)设定为子结构,对立体结构(Stereo)限定为绝对匹配、不匹配、相关的或者外消旋,还可以对其化合价、同位素、附加环等进行限定,然后点击开始检索按钮。
4 组配检索
CrossFireGmelin/Beilstein数据库提供了丰富的组配检索功能,用户可以把结构图、文本或数据进行联合检索,实现更灵活、更准确、更高效的检索目的。
实例4:检索在JournalofMedicinalChemistry(J.Med.Chem)刊物上发表的关于Cromakalim化合物的文章,并将发表日期限制在1991年,就可以进行化学结构和数据的联合检索,具体方法如下:
在结构编辑框中输入化学结构,然后点击列在左边列表框中的预定义检索项(PredefinedSearchForms)中的书目数据(Bibliographicdata)选项,预先定义好的对话框便会弹出来,在刊物名称框中输入刊物名称缩写“J.Med.Chem”。注意:输入的缩写刊物名称的每个词之间必须用空格隔开。逻辑关系选项框中选择“Startswith”,然后点击OK按钮,系统将数据自动转入数据输入框,点击开始检索按钮进行检索。
5 二次检索
CrossFireGmelin/Beilstein数据库还提供了二次检索功能,用户可以根据自己的检索要求对首次检索结果进行组合,进行二次检索,使检索结果更准确。
实例5:检索合成水杨酸的化学反应,而且反应物不含有苯酚,可以通过如下方式检索:
首先在结构编辑窗口画出水杨酸的结构图,在结构检索选项区选择产物,在检索(Search)选项框中选择反应,开始检索。得到检索结果Q1有627条,然后在结构编辑窗口画出苯酚生成水杨酸的反应,在检索(Search)选项框中选择反应,开始检索。得到检索结果Q2有38条,然后点击左上角的hitsets列表,双击Q1和Q2,Q1和Q2自动添加到数据框中,在逻辑关系选项框中,选择非(not),点击开始检索按钮进行检索,检索结果为Q3有589条。
二 检索结果的显示与输出
1 检索结果的显示
检索完成后,CrossFireGmelin/Beilstein数据库会自动切换到检索结果的界面,显示界面以左右两屏显示:左屏呈树形结构的是所检索物质的条目信息,并以编号Q1,Q2⋯排序,点击编号,可逐级打开该条目下的详细记录,定位记录目标,则相对应的详细信息在右屏显示,右屏可以用网格(Grid)和列表(List)两种方式来显示检索结果,而且可以随意的相互切换。Grid显示方式可以在同一个界面上同时显示多条记录,而List显示方式则在一个界面上显示一条记录的详细信息,包括所查物质的识别信息、反应信息、物理性质、化学性质、参考文献等众多方面的信息,记录中与检索条件相匹配的内容将用高亮的背景颜色显示出来。
2 检索结果的输出
CrossFireGmelin/Beilstein能够灵活的对检索结果进行各种处理,帮助用户以各种方式将检索内容自动生成图表和报告,以Word、Excel或html等多种格式进行存储。用户只需在所需条目的右上角的空白框中做标记,然后选择打印(Print)或复制到报告(CopytoReport),就可以对需要的内容进行打印或保存。
综上所述,CrossFireGmelin/Beilstein是个非常强大的数据库,不仅数据涵盖面非常广,并配有强大的搜索引擎以帮助用户以最简单、最直接、最迅捷的方式来找出所需要的数据,而且无论是建立查询还是显示查询结果的界面的设计都十分合理、简单易用,是化学化工研究者必不可少的网上工具。我们应在检索实践中不断总结经验,争取把系统所提供的功能发挥的更好 原作者：xtmxtm
我刚刚使用了一个月,发现这个数据非常好,使用起来直观.但跟SCIFINDER比较来,收集的范围少了点,期刊收集的主要文献(以早期以德文为主)不过比较可靠,专利只收集WO US EP,不过我们准备卖二个数据库期刊和专利.
原作者：丙烷
Crossfire平台上现在有3种数据库，Beilstein,Gmelin, and MDL Patent，他们三个可以同时检索，这样就解决了专利不全的问题。 原作者：biotech7
并不是每个大学的crossfire都相同的，有些但学还买了beilstein plus，另外有些学校有litlink，而有些学校却没有litlink，当然在commander7中，已经用“original document"的连接代替 litlink连接，但是采用的还是litlink3.0
原作者：bhy409
Beilstein对于作合成的用处很大，但感觉对于药物研发者来说SCIFINDER更顺手一些，数据面也广一些。
对于Beilstein，我用结构式索引较多。感觉蛮方便的，在使用中，也经常用字母A和G等来代替结构式中的杂原子和外接官能团，对于A，G等代表的意义不是十分清楚，哪位大侠帮忙解惑一下啊？ 学习一下 beilstein 用的不是很熟 [fly]没用过Beilstein啊,[/fly] [quote]原帖由 [i]何方[/i] 于 2007-11-9 20:07 发表 [url=http://6yes.com/bbs/redirect.php?goto=findpost&pid=871296&ptid=160169][img]http://6yes.com/bbs/images/common/back.gif[/img][/url]
原作者：高分子材料
Beilstein的EasyDataSearch非常有用，在这点上比SciFinder要好，但是Beilstein采用的文献多是发表的期刊文章，专利方面的文献不如SciFinder多，应该说两者结合起来的话最好 [/quote]
Beilstein已经有专利数据库，即在原来的无机、有机库外增加了个专利数据库，专利数据库摘录了操作实例，当是上百页的专利时，这个很有实用。 beilstein 没有用过，安装挺难搞的！ 支持楼主 :lol :lol :) :)
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