无机化学专家帖:peterkf
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美国CDI公司CompuDrug药物研发软件

美国CDI公司CompuDrug药物研发软件

  compudrug软件是有美国CDI公司开发的用于预测药物吸收、分布、代谢、排泄(ADME)的理化参数和毒性,以及预测先导化合物的类似物,基于文献和经验的数据库给出化合物优化修饰的意见。这个软件最大的特点是可以在化合物合成之前就可以预测它在人体内的代谢产物和毒性,可以较精确的计算pka  logp  logd值,是实验研究的好工具。大家可以登陆www.compudrug.com下载DEMO版本和一些英文应用文献。以下是各个模块能实现的一些功能。

1。pallas
⑴ pKalc:化合物合成前,该模块可预测化合物酸和碱的pKa值。化合物在水溶液中的溶解性较低、易分解及pKa太高或太低时,可通过软件计算解决问题。pKalc可准确地计算酸和碱的pKa值,误差范围为0.25 pKa单位。

⑵ PrologP:化合物合成前,该模块可预测化合物的logP值,预测化合物的疏水性。由于化合物可能分解、化合物有毒及logP过大或过小时,该模块在计算logP值可提供准确的预测值。

⑶ PrologD:该模块提供了计算药物吸收和排除及药物研发中所需的logD值,可预测在人体内的吸收过程中不同pH值下的疏水性。药物研发中药物吸收和排除、logD值太大或太小、易发生分解及测定药物亲脂性很困难或不可能时,该模块将解决这类问题。


⑷ EluEX:该模块快速预测HPLC中化合物的分离方法。

⑸ MetabolExpert:该模块是一个在药物研发过程中理想的快速预测化合物代谢产物的程序,是一个基于规则的开放系统,化学家、代谢研究人员等依赖于代谢结构预测的数据能够理解、扩展、修饰或优化结果。


⑹ HazardExper:该模块是一个在药物研发过程中理想的快速预测化合物毒性的工具,可预测化合物的对人体或动物的毒性症状。并是一个基于规则的开放性的系统。

⑺ ToxAlert:该模块将根据筛选数据库中的具有特定药效团化合物的毒性,早期它预测出有毒的候选药物。除了对毒性进行预测外,还可预测药物的致癌性、诱变性、致畸性、神经毒性或细胞毒性。

⑻ MEXAlert:是一个快速的灵敏的高通量辅助筛选提示首过代谢的可能性的工具。在合成化合物之前考虑了新陈代谢,排除其它代谢路径。

⑼ RetroMEX:先导化合物挽救程序。若化合物的生物利用度很低,那么RetroMEX将预测具有良好的生物利用度的化合物。

⑽ Rule of 5:规则认为化合物符合规则(氢的共体<5,分子量<500,氢的受体<10个和Log p<5)中的两个,这个化合物在人体中将很难被吸收。

⑾ TPSA:拓扑极性表面积 (TPSA)可预测人体肠吸收、Caco-2单层渗透性和血-脑屏障渗透,确定具有不适宜的吸收的候选药物。


2。EMIL

预测很多先导化合物的类似物,从而对类似物的进行修饰及化学基团的改造,可快速地进行先导化合物的演化和创新。EMIL是基于实例先导化合物的演化和创新工具,包含两部分:化合物数据库(包括6700多个条目)和数据处理的搜索引擎。

download:www.compudrug.com下载DEMO版本

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不错的东东,学习下

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呵呵,这个我有xx版。
[fly]欢迎光临清清思海[/fly]

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